Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ift140E9PY46 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
Ift140E9PY46 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ift140E9PY46 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ift140E9PY46 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Ift140E9PY46 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ift140E9PY46 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms