Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Srp54bE9PXC0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srp54bE9PXC0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srp54bE9PXC0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms