Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3002E9PW72 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3002E9PW72 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3002E9PW72 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3002E9PW72 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3002E9PW72 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms