Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc62E9PVD1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc62E9PVD1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc62E9PVD1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms