Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FgaE9PV24 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgaE9PV24 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FgaE9PV24 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgaE9PV24 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms