Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp839E9PUU5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp839E9PUU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms