Protein–RNA interactions for Protein: E0CYQ0

Kctd17, MCG13350, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd17E0CYQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kctd17E0CYQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kctd17E0CYQ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kctd17E0CYQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kctd17E0CYQ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kctd17E0CYQ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms