Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
4930407I10RikD3Z5T8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
4930407I10RikD3Z5T8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
4930407I10RikD3Z5T8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
4930407I10RikD3Z5T8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms