Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam46aD3Z5S8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam46aD3Z5S8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam46aD3Z5S8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46aD3Z5S8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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