Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem200bD3Z0P8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200bD3Z0P8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms