Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc8D3YZV8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc8D3YZV8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms