Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lonrf1D3YY23 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lonrf1D3YY23 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lonrf1D3YY23 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
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