Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samd1D3YXK1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samd1D3YXK1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Samd1D3YXK1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms