Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzd8B9EJ80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzd8B9EJ80 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd8B9EJ80 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd8B9EJ80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms