Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf11cB4XVP9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Phf11cB4XVP9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf11cB4XVP9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf11cB4XVP9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms