Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Siah3B2RWG3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Siah3B2RWG3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Siah3B2RWG3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms