Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfc3h1B2RT41 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfc3h1B2RT41 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfc3h1B2RT41 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfc3h1B2RT41 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms