Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brpf1B2RRD7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brpf1B2RRD7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Brpf1B2RRD7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brpf1B2RRD7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brpf1B2RRD7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms