Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Phf3B2RQG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Phf3B2RQG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf3B2RQG2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms