Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CK137956B1AYM9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CK137956B1AYM9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CK137956B1AYM9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms