Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a6B1AVK5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col4a6B1AVK5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a6B1AVK5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a6B1AVK5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a6B1AVK5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms