Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll11A4Q9F4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll11A4Q9F4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms