Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm6880A3KG45 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm6880A3KG45 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm6880A3KG45 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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