Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Palm3A2TJV2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Palm3A2TJV2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Palm3A2TJV2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Palm3A2TJV2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Palm3A2TJV2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms