Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fibcd1A2AV25 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fibcd1A2AV25 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fibcd1A2AV25 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fibcd1A2AV25 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms