Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb1A2AQ07 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb1A2AQ07 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms