Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec16aA2AIX1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec16aA2AIX1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec16aA2AIX1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec16aA2AIX1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec16aA2AIX1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec16aA2AIX1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec16aA2AIX1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec16aA2AIX1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec16aA2AIX1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec16aA2AIX1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec16aA2AIX1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms