Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin3aA2AIR5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin3aA2AIR5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Grin3aA2AIR5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3aA2AIR5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142 ms