Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2dnl2A2AFH2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2dnl2A2AFH2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2dnl2A2AFH2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms