Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
C87977A2A958 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87977A2A958 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87977A2A958 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C87977A2A958 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C87977A2A958 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87977A2A958 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C87977A2A958 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C87977A2A958 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C87977A2A958 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C87977A2A958 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C87977A2A958 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87977A2A958 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87977A2A958 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms