Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprfA2A8L5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprfA2A8L5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprfA2A8L5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprfA2A8L5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprfA2A8L5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1145.5 ms