Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hivep3A2A884 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Hivep3A2A884 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hivep3A2A884 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms