Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gpatch8A2A6A1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gpatch8A2A6A1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gpatch8A2A6A1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gpatch8A2A6A1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gpatch8A2A6A1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gpatch8A2A6A1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Gpatch8A2A6A1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Gpatch8A2A6A1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Gpatch8A2A6A1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Gpatch8A2A6A1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Gpatch8A2A6A1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Gpatch8A2A6A1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Gpatch8A2A6A1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms