Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc194A0A140LIT1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc194A0A140LIT1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc194A0A140LIT1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc194A0A140LIT1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.8 ms