Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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