Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUM8

Gm45140, Predicted gene 45140, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45140A0A0N4SUM8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gm45140A0A0N4SUM8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gm45140A0A0N4SUM8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Gm45140A0A0N4SUM8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Gm45140A0A0N4SUM8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Gm45140A0A0N4SUM8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Gm45140A0A0N4SUM8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Gm45140A0A0N4SUM8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Gm45140A0A0N4SUM8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Gm45140A0A0N4SUM8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gm45140A0A0N4SUM8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24,3■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24,3■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24,26■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Gm45140A0A0N4SUM8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Gm45140A0A0N4SUM8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
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