Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms