Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trbv21A0A0A6YX06 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Trbv21A0A0A6YX06 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Trbv21A0A0A6YX06 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv21A0A0A6YX06 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trbv21A0A0A6YX06 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trbv21A0A0A6YX06 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv21A0A0A6YX06 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Trbv21A0A0A6YX06 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Trbv21A0A0A6YX06 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Trbv21A0A0A6YX06 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trbv21A0A0A6YX06 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Trbv21A0A0A6YX06 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trbv21A0A0A6YX06 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Trbv21A0A0A6YX06 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trbv21A0A0A6YX06 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Trbv21A0A0A6YX06 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Trbv21A0A0A6YX06 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Trbv21A0A0A6YX06 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Trbv21A0A0A6YX06 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Trbv21A0A0A6YX06 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Trbv21A0A0A6YX06 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Trbv21A0A0A6YX06 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv21A0A0A6YX06 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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