Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ44

Srcap, Snf2-related CREBBP activator protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrcapA0A087WQ44 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrcapA0A087WQ44 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrcapA0A087WQ44 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SrcapA0A087WQ44 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrcapA0A087WQ44 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SrcapA0A087WQ44 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SrcapA0A087WQ44 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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