Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.3 ms