Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms