Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP35Q9P2H5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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