Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmod4Q9JLH8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms