Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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OtofQ9ESF1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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OtofQ9ESF1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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OtofQ9ESF1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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OtofQ9ESF1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtofQ9ESF1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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