Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndst3Q9EQH7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms