Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp12Q9D9M2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms