Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necab3Q9D6J4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms