Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc83Q9D4V3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms