Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift27Q9D0P8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ift27Q9D0P8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ift27Q9D0P8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ift27Q9D0P8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ift27Q9D0P8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift27Q9D0P8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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