Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpainQ9CWY9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RpainQ9CWY9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RpainQ9CWY9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RpainQ9CWY9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms